Образование высшее, окончил Павлодарский индустриальный институт по специальности «Технология машиностроения, металлорежущие станки и инструменты». Трудовую деятельность начал в сентябре 1981 года слесарем ОГМ по ремонту оборудования, затем работал мастером, начальником автоотряда, начальником по эксплуатации автоколонны № 2565 Павлодарского грузового автоуправления, заместителем начальника Павлодарского производственного объединения автовокзалов и автостанций. С 1990 года возглавил Павлодарский автовокзал, правопреемником которого после реорганизаций является ТОО «Автовокзалсервис». Сегодня автовокзал – это удобный многофункциональный комплекс. В ТОО работают высокопрофессиональные работники и водители. Е.Пилипенко награжден Нагрудными знаками «Құрметті автокөлікші» («Почётный автотранспортник») и «Құрметті автокөлікші» ( «Почётный дорожник»)